暖通空调系统能耗占建筑能耗约60%，所以暖通空调的节能在建筑节能方面尤为重要。而洁净车间的净化空调系统比普通空调系统更加复杂，投资更大，主要体现在洁净空调送风量大、风机压损大、冷热负荷大、恒温恒湿要求等因素。使得净化空调系统比普通空调系统的运行能耗高出十余倍左右，增加工厂企业生产产品的成本费用。因此，在满足企业高精产品生产需求和符合行业生产质量管理规范的情况下，采用净化空调系统节能方案措施，将大大降低企业的运行成本。
一：风量大，风机压头高。洁净车间通过循环过滤足够的风量来达到洁净度的标准。风量一般按照室内换气次数来计算，通常是房间体积的10倍，甚至几十倍，尤其是百级、十级等单向流洁净室，换气次数达到房间体积的几百倍。净化风量通过初、中、高三级过滤器过滤和通过较长的风管输送管道送到车间，克服这些阻力和其他系统内的设备和配件的相关阻力，压力损失大概1000Pa左右。那么空气处理机组要提供这么大的压头，则需要相匹配的功率提供动力。
二：温湿度控制要求高。洁净车间的恒温恒湿要求是为了满足工艺生产的需求，如在某些电子产品的制造中，对温湿度的控制要求非常严格，在医用和实验动物等方面，对温湿度的控制精度也有明确的要求。为了实现恒温恒湿，那么要求空气处理机组中至少要具备制冷、制热、加湿、除湿等功能段，而且需要精密控制的方式；并且水流量采用比例积分控制，加湿量也要采用比例积分或者是PID调节的方式，以便实现更高的控制精度。
三：空调冷热负荷大。因为一般洁净车间的生产设备多，设备功率大，散热量大；第二补偿室内排风和保持正压值所需要的新风较大；第三维护结构散热和生产人员散热等负荷；所以洁净车间空调系统的冷热负荷比普通空调大得多，增加制冷设备的规模和运行能耗。
